新界區專線小巴44線 是由 冠榮車行 旗下的運泰實業營辦的一條專線小巴線，來往 屯門碼頭 至 上水站 [ 1 ] 。 本線的「屯門碼頭」總站，並非設在海翠花園地下的 屯門碼頭公共運輸交匯處 ，而是鄰近 慧豐園碼頭 的小巴總站。 為解決 屯門公路 大欖段爬山線工程完工前，日趨惡化的交通擠塞問題，運輸署於1995年計劃推出兩條 專綫小巴 路線，提供 屯門碼頭 渡輪接駁服務，此路線乃其中一條。 [ 2 ] 1995年12月：運輸署公開招標12組共17條專線小巴新路線，此路線及 45 、 49S 編為同一組。 [ 3 ] 1997年1月13日：投入服務，當時全程收費$13，當時此線在屯門市中心及元朗公路之間會途經屯門工業區、大興邨、良景邨、田景邨、建生邨、兆康苑等地。同年3月20日，來回程皆繞經落馬洲管制站，以配合皇巴士投入服務。 [ 4 ] 1998年5月23日：往上水火車站方向改經博愛交匯處後新落成一段的元朗公路前往新田公路，不經凹頭，取消東成里站。 1998年5月24日：往屯門碼頭方向改經新落成一段的元朗公路前往博愛交匯處，不經凹頭，取消楊屋村站。 1998年：來回程改經杯渡路直接進出屯門公路；原有在屯門工業區、大興邨、良景邨及兆康苑的服務由新線44A取代。 1999年：來回程不再繞經落馬洲，由44B提供。 2009年2月20日：來回程不停屯門公路紅橋。 2009年3月15日：來回程恢復停靠屯門公路紅橋。 2015年8月30日：屯門總站遷往新落成的湖山路小巴總站。 1987年10月9日：運輸署公開招標9組共18條專綫小巴新路線，此線與 43 編為同一組。招標時總站設於 龍鼓灘 ，並指明持牌人經營此線的權利擬根據輕鐵的發展於1989年中予以檢討。 [ 5 ] 1988年5月10日：此線投入服務，由冠榮車行旗下中西區小巴服務營運，總站設於 新青街 。 [ 6 ] 1988年9月25日：因輕便鐵路通車而取消，由 輕鐵接駁巴士520線 取代。 屯門碼頭 開：05:00-00:00 每5-13分鐘一班 上水站 開：05:40-01:00 每5-13分鐘一班（【期間或客滿即開】） 豐景園 開往上水站：0800-0830，每8分鐘一班

屯門碼頭 來往 紅橋 ：$6.5 屯門碼頭（ 慧豐園 ）開:途經： 湖山路 、 龍門路 、 皇珠路 、 海皇路 、 海珠路 、 屯門鄉事會路 、 杯渡路 、 屯門公路 、 元朗公路 、 青朗公路 、 新田公路 、 粉嶺公路 、 雞嶺迴旋處 、 掃管埔路 、支路、 新運路 、 龍琛路 及 龍運街 上水站開: 新運路 、 龍琛路 、 龍運街 、 新運路 、 掃管埔路 、 雞嶺迴旋處 、 粉嶺公路 、 新田公路 、 青朗公路 、 元朗公路 (如有乘客要求於「富泰橋底」(青山公路-嶺南段(地面)與元朗公路(天橋)相交點)下車,司機會繞徑藍地交滙處後前往屯門公路)、 屯門公路 、 杯渡路 、 屯門鄉事會路 、 海珠路 、 海皇路 、 皇珠路 、 龍門路 、 湖翠路 及 湖山路 前往內地（轉乘 東鐵綫 ）及水貨客 屯門往返上水，及到上水站轉乘東鐵綫往返粉嶺及大埔區 此路線服務質素為不少乘客所詬病。由於此路線大部份路段均是快速公路，是現時少數日間長途專綫小巴路線之一，而駕駛此路線之車長的收入並非按固定月薪計算，而是按單一車長的乘客車費收入和營運商「三七分帳」，車長為求增加收入，經常超速行走。 屯門區議會 經常收到乘客投訴，指小巴車長經常超速駕駛， 上水 前往 虎地 甚至更遠的車程往往需時少於15分鐘，時速更達到120公里以上 [ 7 ] [ 8 ] ，而且沿線不少乘客經常難以登車 [ 9 ] ；更甚者，部份投訴指出車長不依路線行駛及拒載屯門區內的短途客。 運輸署 收到有關此路線之投訴如雪片飛來，引致署方早已要求九巴開辦一條每天全日往返屯門及上水的巴士路線，以引入競爭及逼使小巴營辦商改善服務，但受到此路線營辦商強烈反對。在不斷角力下， 九龍巴士261線 終於在2000年6月4日起投入服務；不過此路線定線較直接，加上運用車海戰術得宜，班次密度遠超261線，雖收費較高但依舊客似雲來，而服務質素亦未見太大改善。 現時此路線所有用車已按法例鎖速至時速最高80公里，與其他小巴無異。 ^ 運輸署- 新界區專線小巴路線第44號 . [ 2016-12-18 ] . （原始内容 存档 于2016-12-21）. ^ 屯門公路運輸及交通問題 （ 页面存档备份 ，存于 互联网档案馆 ），立法局專責小組，1995年11月 ^ 第5081號公告，香港政府憲報第137卷第49期，1995年12月8日。 ^ 〈落馬洲與皇崗過境穿梭巴士明投入服務〉，香港政府新聞公報，1997年3月19日。 ^ 第3368號公告，香港政府憲報第129卷第41期，1987年10月9日。 ^ 《屯門下週增開兩條專線小巴》，華僑日報，1988-05-08 ^ 44號專線小巴乘客投訴司機違規 （ 页面存档备份 ，存于 互联网档案馆 ），蘋果日報，2005年9月6日 ^ 44號專線小巴偷雞超速 （ 页面存档备份 ，存于 互联网档案馆 ），蘋果日報，2008年7月25日 ^ 44綠巴飛站拒載招客怨 （ 页面存档备份 ，存于 互联网档案馆 ），蘋果日報，2003年11月5日